Музей начал своё существование с 1969 года, под руководством Рима Зайнигабитовича Янгузина.
Музей служит важнейшим инструментом в изучении истории и культуры башкирского народа на подлинных памятниках, собранных в результате кропотливой собирательской и научно-исследовательской работы.